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Quantitative Functional Proteomics

Quantitative Functional Proteomics (QF-Pro®)es un ensayo de bio-imagen puntero desarrollado por Hawk Biosystems. 

QF-Pro® es la única tecnología que cuantifica eventos proteómicos funcionales, como PPIs o modificaciones post-transnacionales de proteínas, directamente sobre muestras de tejido. 

Esta tecnologia esta basada en un FRET, pero, a diferencia de la tecnología FRET, la tecnología de amplificación de QF-Pro® permite que el FRET funcione con tejido FFPE de manera fiable, una proeza que era hasta hace poco imposible.

Características

  • Cuantifica funciones de proteínas dentro de muchos tipos de muestra (Tejido, células, PBMC…)
  • Mapeado espacial de eventos proteicos a través del microambiente tumoral.
  • El único ensayo espacial cínicamente validado en el campo de la inmuno-oncología. 
  • Kits fáciles de usar, con todos los reactivos necesarios para realizar un ensayo QF-Pro®. 
  • Violet 3.0, un sistema de visualización diseñado a medida para la lectura de un ensayo QF-Pro®. 
  • El mejor rango dinámico que proporcionan unos valores de corte imparciales en el ámbito clínico.

¿Cómo funciona?

QF-Pro® se basa en modificaciones de la tecnología FRET/FLIM, permitiendo que este ensayo realice mediciones de entre 1 y 10 nm para cuantificar espacialmente las funciones de proteínas con una resolución sin precedentes en el mercado.

Dos epítopos se marcan simultáneamente utilizando anticuerpos primarios específicos para luego ser detectados con reactivos de marcado secundarios conjugados a diferentes fluoróforos: Uno actúa como donador de energía FRET y el otro actúa como aceptor. Lo que diferencia a QF-Pro® es la amplificación patentada del fluoróforo aceptor, que aumenta la relación señal-ruido al menos 4 veces.

Por último, la plataforma hardware, Violet 3.0, y su software especializado mide automáticamente la distancia entre los dos fluoróforos, permitiendo cuantificar la interacción o la modificación postraduccional de una proteína directamente sobre la muestra de tejido. 

 

Una combinación de sensibilidad y especificidad sin precedentes

Gracias su naturaleza estereoscópica, los ensayos QF-Pro® tienen una especificidad y una sensibilidad sin precedentes, especialmente cuando se les compara con otras tecnologías similares. 

Gracias a la capacidad del software de cuantificar la información con resolución sub-pixel, las imágenes conseguidas son más nítidas y precisas, y permiten una lectura mucho más fiable. 

QF-Pro® mide distancias inferiores a 10 nm directamente sobre muestras de tejido fijado para determinar el estado funcional de las proteínas dentro del mismo. Este elevadísimo rango dinámico puede distinguir la distancia exacta entre dos proteínas, midiendo hasta 0.01 nm de separación.

A diferencia de los resultados obtenidos por tecnologías similares, este ensayo opera sin ningún riesgo de falso positivo mientras aporta una especificidad tan alta que permite hacer mediciones a una escala celular. 

Adicionalmente, el uso de dos cromatoforos distintos muy específicos permite evitar los problemas asociados al uso de anticuerpos no específicos en técnicas inmunohistoquímicas o de inmunofluorescencia.

anti pd table

*Para predecir la respuesta a terapias anti-PD-1/PDL-1 en cáncer de pulmón en células no pequeñas.


Quantitative Functional Proteomics
Entrevista a José Luis Cortés
José Luis Cortés, destacado investigador, product manager de Lifescience y miembro de Proquinorte, es reconocido por crear las primeras líneas de células embrionarias humanas de Andalucía. Gracias al innovador uso de la tecnología láser, ha conseguido marcar un hito a nivel mundial.
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